Gmina leży na Wysoczyźnie Polanowskiej i Równinie Białogardzkiej. Przez południową część gminy przepływa Radew tworząca Jezioro Rosnowskie, rzeka jest dostępna dla kajaków. W gminie znajdują się 2 rezerwaty: przy granicy z Koszalinem, Jezioro Lubiatowskie, a nad rzeką Radew, Kręgi Kamienne. Przez gminę prowadzi czerwony szlak turystyczny pieszy im. J. Chrząszczyńskiego z Góry Chełmskiej do Tychowa oraz kilka szlaków turystycznych rowerowych, m.in. niebieski i czerwony wzdłuż Radwi. Tereny leśne zajmują 66% powierzchni gminy, a użytki rolne 23%.
Przez gminę Biesiekierz prowadzi droga krajowa nr 11 łącząca Manowo z Koszalinem (12 km) i Bobolicami (27 km) oraz drogi wojewódzkie nr 168 z Wyszewa (4 km od Manowa) do Niedalina (17 km, skrzyżowanie z drogą nr 167 Koszalin - Tychowo) i skrzyżowanie z drogą nr 205 Bobolice - Polanów).